Nadat je Whitney hebt verslagen, ligt de volgende Pokémon Gym in het nabijgelegen Ecruteak City. De weg naar Ecruteak City wordt echter geblokkeerd door een vreemde dansende boom.
Goldenrod City
Loop vanaf de Goldenrod City Gym naar het oosten, en je zult twee huisjes zien. Ga het bovenste huisje binnen en praat met de vrouw met de rode jurk. Als ze ziet dat je de Plain Badge het gewonnen, zal ze je een SquirtBottle geven. Deze heb je nodig om de boom tussen Goldenrod en Ecruteak weg te krijgen.
Verlaat Goldenrod City door de poort naar het noorden om de volgende Route te bereiken. Praat in de poort met de man achter de balie, en hij zal je om een gunst vragen. Hij heeft een Spearow met Mail, die hij aan een vriend wil bezorgen. Als je ruimte hebt in je team, zul je zijn Spearow aannemen. Je kunt de Mail lezen, maar zorg dat je hem niet verwijdert! Zolang je Kenya in je bezit hebt, kun je hem ook in gevechten gebruiken, maar uiteindelijk zul je hem weer moeten afstaan aan de vriend van de poortwachter.
Route 35
Route 35 is kort, maar bezaaid met Trainers! Zelfs de politieagent bij de poort naar het noorden zal je uitdagen als het nacht is. In het noorden van Route 35 vind je de ingang van het National Park. Je kunt door het National Park lopen om bij Route 36 komen, of je kunt bij de poort naar rechts, door het gras en langs het Cut-boompje naar het noorden. Je kunt er ook voor kiezen om een kleine tussenstop bij Pokéathlon te maken.
Loop in ieder geval een keer door het gras naar rechts en naar het zuiden, om TM66 Payback te vinden. Als je wilt, kun je het nummer registreren van Bug Catcher Arnie; hij zal je bellen als hij wilde Yanma spot, die normaal erg zeldzaam zijn.
National Park
Loop vanaf de zuidelijke ingang van het National Park eerst naar rechts om een stel bankjes te vinden. Op één bankje vind je een vrouw met haar Persian; spreek haar aan om een Quick Claw te ontvangen. Als je verder loopt naar het noorden, kom je bij een grasperk in de vorm van een grote Poké Ball. In het gras kun je wilde Pokémon vangen, maar de Trainers in het gras zullen je uitdagen.
In de noordoostelijke hoek van het park vind je een gat in de omheining, net naast een jongen die op zijn Nintendo 3DS speelt. Loop tegen de klok in buiten de omheining, en je kunt in de zuidwestelijke hoek TM28 Dig vinden.
Als je alles gezien hebt, verlaat dan het park door de poort in het noordoosten.
Route 36
Nadat Sudowoodo weg is, loop dan naar rechts tot je een man ziet. Praat met hem, en hij zal je bedanken met TM36 Rock Smash. Deze TM kun je later gebruiken om rotsen op je pad op te ruimen.
Ga dan verder door naar het noordwesten, en je zult op het korte Route 37 komen.
Route 37
Je kunt hier naar rechts door het gras lopen om drie Apricorn-bomen te vinden. Als het zondag is, vind je hier ook Sunny, die de eerste keer een Magnet voor je heeft, en de tweede keer een Smile Ribbon.
Blijf verder naar het noorden lopen en je bereikt al snel Ecruteak City.
Ecruteak City
Meteen bij je binnenkomst in Ecruteak City zul je het Pokémon Center zien. Als je naar binnen loopt, ontmoet je Bill, de beheerder van het Pokémon Storage System. Hij vertelt je het een en ander over Lanette uit Hoenn, en verandert de naam van je PC van “Someone's PC” naar “Bill's PC”. Nadat Bill dit gedaan heeft, zal hij vertrekken. Als je wilt, kun je hem later bezoeken in zijn huis, in het zuidwesten van Goldenrod City; hij zal je dan een Lv. 5 Eevee geven.
In het huisje links van het Pokémon Center vind je een jongen die een boek aan het lezen is. Spreek hem aan en antwoord YES, en hij zal je de Dowsing MCHN geven. Hiermee kun je verborgen voorwerpen opsporen.
Helemaal linksonder in de stad vind je de Pokémon Gym, maar hier kun je helaas nog niet in en dus zul je later moeten terugkomen.
Net iets ten noorden van het Pokémon Center vind je de Dance Hall. Binnen zie je een Kimono Girl en een lid van Team Rocket. Versla dit Team Rocket lid en als dank geeft de Kimono Girl je HM03 Surf.
In het noordwesten van de stad vind je de Burned Tower. Bereid je voor op een gevecht voordat je de toren betreedt!
Burned Tower
Zodra je binnenkomt, zul je een nieuw personage ontmoeten: Eusine. Hij en zijn vriend Morty (de Gym Leader) zijn op zoek naar de legendarische Pokémon Suicune.
Loop eerst tegen de klok in, en gebruik Rock Smash op de rots rechtsboven; hierachter ligt een HP Up. Ga dan tegen de klok in en je zult het midden van de toren bereiken, waar je je rivaal zult tegenkomen. Hij zal je uitdagen voor een gevecht.
Na het gevecht kun je naar beneden lopen om de drie legendarische Pokémon ontmoeten: Suicune, Raikou en Entei! Loop dan weer terug naar beneden, waar je Eusine nogmaals tegenkomt. Vervolgens kun je de ladder gebruiken om de Burned Tower te verlaten.
Nadat je Suicune, Entei en Raikou gezien hebt in de Burned Tower, zul je ze in het wild tegen kunnen komen. De drie Pokémon reizen de hele Johto-regio af, en zijn steeds maar op één plek te vinden. Ook zullen ze meteen vluchten na één beurt. Je zult dus geluk en doorzettingsvermogen moeten hebben om één van deze legendarische Pokémon te kunnen vangen.
Het is nu tijd om de Gym Leader uit te dagen!
Ecruteak City Gym
De Gym in Ecruteak City is wat ingewikkeld dan de vorige Gyms, want er schijnt niet veel licht! Als je een verkeerde stap zet, zul je worden teruggebracht naar het begin.
Voor het verslaan van Morty ontvang je de Fog Badge! Deze zorgt ervoor dat geruilde Pokémon tot Level 50 je gehoorzamen, en laat je Surf gebruiken buiten gevechten. Daarnaast versterkt het de Ghost-type aanvallen van jouw Pokémon, buiten gevechten met andere spelers. Morty geeft je ook TM30 Shadow Ball, een krachtige Ghost-type aanval.
Na Ecruteak City kun je twee kanten op. Je kunt naar het westen richting Olivine City om de Storm Badge en Mineral Badge te winnen, of je kunt naar het oosten richting Mahogany Town voor de Glacier Badge. Qua moeilijkheidsgraad maakt het niet uit; de keuze is aan jou!